Рак простате: Велики подаци откључавају 80 нових мета
У највећој студији за анализу генетике рака простате, научници проналазе не мање од 80 нових потенцијалних мета лекова. Пројекат отвара широке могућности за дизајн нових третмана.
Вађење генетских података био је једном давно тежак и невероватно дуготрајан задатак.
Међутим, како се технологија наставља побољшавати, посао је постао знатно бржи и јефтинији.
Паралелно с тим, алати доступни за руковање великим скуповима података су се знатно побољшали.
Све заједно, то значи да се океани података прикупљених генетским кодом могу анализирати, мапирати и комбиновати са релативно лакоћом како би се добио нови ниво јасноће.
Недавно је међународни тим користио овај двоструки приступ ДНК анализе и великих података да би се позабавио генетиком карцинома простате. У потрази за молекуларним зглобовима у оклопу болести, истраживање је организовао Институт за истраживање рака у Лондону, Велика Британија.
Изазови карцинома простате
Рак простате је други најчешћи рак међу мушкарцима у Сједињеним Државама. Ове године ће се у САД-у проценити 164.690 нових случајева рака простате и скоро 30.000 смртних случајева од ове болести.
Иако су истраживачи напредовали у разумевању и лечењу рака простате, и даље постоји низ потешкоћа.
Како објашњава вођа студије проф. Росалинд Еелес, „Један од изазова с којима се суочавамо у истраживању рака је сложеност болести и велики број начина на које бисмо је могли потенцијално лечити“.
Др Јустине Алфорд, из Цанцер Ресеарцх УК, износи још једно питање у проучавању и интервенцији на раку простате.
„Главна препрека даљем напретку против рака простате је“, објашњава она, „недостатак начина да се тачно предвиди како ће нека болест напредовати, чинећи изазовним знати који је третман најбољи за сваког пацијента.“
Сакупљање генетских података
Да би приступили проблему из новог правца, истраживачи су узели генетске информације од 112 мушкараца са раком простате и комбиновали их са подацима из низа других студија. Укупно су коришћени узорци од 930 пацијената.
Користећи најновије технике великих података, тим је стекао нови увид у генетске промене које подстичу развој и подстичу напредак рака простате. Једном када су схватили о којим генима је реч, могли су да направе мапу протеина који су кодирани тим генима.
Затим су се окренули бази података која се зове цанСАР, која комбинује податке из студија, примењује машинско учење и помаже у пружању увида у откривање лекова.
ЦанСАР на својој веб страници може да објасни питања на која њихова база података жели да одговори: „Шта је познато о протеину, у којим карциномима је он изражен или мутиран и који хемијски алати и модели ћелијских линија могу да се користе за експериментално испитивање његове активности? Шта је познато о леку, његовом профилу ћелијске осетљивости и које протеине је познато да веже што може објаснити необичну биоактивност? “
Научници су открили да је 80 протеина које су открили потенцијалне мете лекова. И њих 11 је било циљано постојећим лековима, а седам других могло би бити мета већ лекова у клиничким испитивањима.
Њихови налази су објављени ове недеље у часопису Натуре Генетицс.
„У нашој студији примењене су најсавременије технике у анализи великих података како би се открило мноштво нових информација о раку простате и могућим начинима борбе против болести.“
Проф. Росалинд Еелес
Поглед у будућност
Открића ће захтевати даља проучавања пре него што се могу клинички користити, али пружају читав низ нових могућности.
Како објашњава коаутор проф. Паул Воркман, „Ова студија открила је изузетно велики број нових гена који покрећу развој рака простате и пружила нам виталне информације о томе како да искористимо биологију болести да бисмо пронашли потенцијалне нове третмане. ”
Нада се да ће њихов рад „стимулисати талас нових истраживања генетских промена и потенцијалних циљева лекова [које су они идентификовали], са циљем да пацијенти имају користи што је пре могуће“.
Још један камен спотицања за дизајн третмана рака простате је начин на који болест различито напредује код сваког појединца. Због тога је много теже одлучити које су опције лечења најбоље за сваког пацијента.
Доктор Алфорд се нада да „[б] у великој мери побољшавајући наше разумевање генетике која стоји иза болести, [...] у будућности, ово знање могло би помоћи лекарима да боље прилагоде лечење карциному појединца и надамо се да ће више људи преживети своју болест. ”
Ово су рани дани, али налази који ће произаћи из следеће генерације студија могли би да трансформишу терен.
