Истраживачи откривају скоро 2.000 нових бактерија у цревима
Према бројним недавним студијама, популације бактерија људског црева способне су да утичу на различите аспекте нашег физичког и менталног здравља. Упркос томе, многе бактерије остају „неуцртане“ од стране научника. Нова студија је сада открила приближно 2.000 раније непознатих бактерија у цревима.
Недавне студије које покрива Медицинске вести данас су показали да микробиота црева може имати улогу у Паркинсоновој болести и деменцији и могу објаснити зашто лекови за дијабетес типа 2 добро делују на неке, али не и на друге.
Ново истраживање - јуче у часопису Природа - сада је идентификовао скоро 2.000 нових бактеријских врста у цревима које научници никада раније нису узгајали у лабораторији.
Тим истражитеља, из Европског института за биоинформатику (ЕМБЛ-ЕБИ) и Института Веллцоме Сангер, оба из Хинктона, Уједињено Краљевство, користио је рачунарску анализу за процену узорака микробиома црева од учесника широм света.
„Рачунарске методе омогућавају нам да разумемо бактерије које још не можемо да узгајамо у лабораторији“, објашњава аутор студије Роб Финн из ЕМБЛ-ЕМИ.
„Коришћење метагеномије [анализа генетског материјала] за реконструкцију бактеријских генома помало је попут реконструкције стотина загонетки након помешања свих делова, не знајући како коначна слика треба да изгледа и након потпуног уклањања неколико делова са мешајте само да то буде мало теже “, наставља он.
Међутим, Фин наставља даље, „Истраживачи су сада у фази када могу да користе читав низ рачунарских алата како би допунили и понекад усмеравали лабораторијски рад, како би открили нове увиде у људска црева.“
Нови приступ
Тим је успео да реконструише 92.143 генома из узорака из 11.850 различитих микробиота црева.
Ово је истраживачима омогућило да идентификују 1.952 врсте бактерија у цревима за које они и други нису знали до овог тренутка.
Финн и колеге објашњавају да су многе бактеријске врсте „задржале ниски профил“, да тако кажемо, јер су их научници пронашли у врло малом броју у цревима или не могу преживети ван цревног окружења.
То је, примећују, до сада спречавало научнике да додају такве врсте на свој списак цревних бактерија за које знају. Из тог разлога је и тим који је спровео тренутну студију одлучио да крене новом рутом - и да користи комбинацију рачунарских метода како би покушао да дође до свеобухватније „мапе“ људске микробиоте.
„Рачунарске методе омогућавају нам да добијемо представу о многим бактеријским врстама које живе у људском цреву, како су еволуирале и какве улоге могу играти у својој микробној заједници“, каже коаутор студије Александер Алмеида.
Према стварању „чврстог плана“
„У овој студији“, објашњава Алмеида, „искористили смо најопсежније јавне базе података о гастроинтестиналним бактеријама да бисмо идентификовали бактеријске врсте које раније нису виђене. Методе анализе које смо користили високо су поновљиве и могу се применити на веће, разноврсније скупове података у будућности, што омогућава даље откривање. “
У будућности, истраживачи се надају да ће ова и сличне студије даље помоћи њиховом разумевању људског црева, што ће заузврат допринети развоју бољих третмана различитих стања.
„Оваква истраживања помажу нам у стварању такозваног плана људског црева, који би нам у будућности могао помоћи да боље разумемо људско здравље и болести, па чак и да води дијагнозу и лечење гастроинтестиналних болести.“
Коаутор студије Тревор Лавлеи, са Института Веллцоме Сангер
Истовремено, тим примећује да је ова студија учинила истраживаче свеснијим великог јаза у истраживањима око цревних бактерија.
Научници тренутно знају релативно мало о бактеријским врстама које су карактеристичне за популације које нису оне које насељавају Европу и Северну Америку, наглашавају истражитељи.
„Видимо да се мноштво истих бактеријских врста појавило у подацима европских популација и северноамеричких популација. Међутим, неколико јужноамеричких и афричких скупова података којима смо имали приступ за ову студију открило је значајну разноликост која није била присутна у бившим популацијама “, напомиње Фин.
„То сугерише да је прикупљање података од недовољно заступљене популације од суштинске важности ако желимо постићи заиста свеобухватну слику о саставу људског црева“, додаје он, позивајући истраживаче да се и даље фокусирају на разноврсније кохорте.
